非法占用农用地案件不属于林业公安机关管辖，应由地方县级以上公安机关的治安部门负责侦办。归属《刑法》第六章第六节破坏环境资源保护罪中的各类犯罪，只有三百四十一条、三百四十四条、三百四十五条属于林业公安机关管辖。